ICS 07.080 A 40 中华人民共和国国家标准 GB/T 34798—2017 核酸数据库序列格式规范 Formats specifications of nucleotide sequence database 2017-11-01发布 2018-05-01实施 中华人民共和国国家质量监督检验检疫总局 发布 中国国家标准化管理委员会 GB/T 34798—2017 目 次 前言 1 范围 规范性引用文件 2 3 术语和定义 缩略语 4 核酸序列格式规范制定的总则 5 核酸序列描述规范 6 7 核酸序列特征描述规范 核酸序列格式规范 8 6 核酸序列文件整体格式规范 附录A（资料性附录） 核苷酸含义表 附录B（资料性附录） 与核酸相关的特征关键词表 附录C(资料性附录) 密码子表 10 附录D（资料性附录） 修饰碱基表 11 附录E（资料性附录) 限定词中英文对照表 13 附录F（资料性附录） 核酸序列文件样例 14 附录G（资料性附录） 行首大写字母含义表 15 参考文献 16 GB/T 34798—2017 前言 本标准按照GB/T1.1一2009给出的规则起草 本标准由全国生化检测标准化技术委员会（SAC/TC387)提出并归口。 本标准起草单位：深圳华大基因研究院、深圳华大基因科技有限公司、广东省标准化研究院、广东产 品质量监督检验研究院， 本标准主要起草人：魏晓锋、陈凤珍、刘克、杜佳婷、李倩一、沈维燕、李启沅、谢强、王娟、谭嘉力 宋祚锟、黄江勇。 GB/T 34798—2017 核酸数据库序列格式规范 1范围 本标准规定了核酸数据库的序列格式，包括生物体基因组核酸序列特征规范制定的总则、序列描述 格式规范、序列特征描述规范和序列格式规范等 本标准适用于生物体基因组核酸数据库序列文件的编写。 规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件，仅注日期的版本适用于本文 件。凡是不注日期的引用文件，其最新版本（包括所有的修改单）适用于本文件。 GB/T29859生物信息学术语 ZC0003核苷酸和/或氨基酸序列表和序列表电子文件标准 3 术语和定义 GB/T29859界定的以及下列术语和定义适用于本文件。 3.1 核酸数据库 nucleicaciddatabase 以核酸序列为基本内容，并附有核酸序列注释信息的数据库。 3.2 编码序列 J coding sequence 编码一段蛋白产物的序列，始于起始密码子，终于终止密码子。 3.3 序列组装 sequenceassembl 基因组长序列打断之后形成较短的序列，通过算法和计算机的帮助，把这些短的序列组装起来成为 一条完整有序的序列的过程。 3.4 甲基化 methylation 蛋白质和核酸的一种重要的修饰，调节基因的表达和关闭。 3.5 识别码identifier 某个体系中相对唯一的编码。 3.6 位置location 一个或一段碱基在另一段较长碱基上的相对坐标位置。 3.7 特征限定词 featurequalifier 用来进一步描述序列的某一类特征的词。 1